bộ phim Lạc Vào Kí Ức thuyết minh là 2 câu chuyện xoay quanh 2 nhân vật, ở 2 bối cảnh, 2 thời điểm khác nhau, về 2 loại vật thể, 2 cuộc sống gần như trái ngược… tất cả như tạo dựng nên những tình tiết kì bí, không thể giải thích bằng khoa học đan xen với những sự kiện thăng trầm rất đỗi bình thường trong cuộc sống hằng ngày.

Một phần bộ phim kể về cậu bé Ayumu bỗng dưng gặp những điều lạ lùng trong kì nghỉ hè của mình tại ngôi làng Tana dân dã – nơi mà lúc nhỏ Ayumu đã từng sống. Tại đây, cậu bé đã gặp một cô gái tên Miku, một người khá là bí ẩn và có vẻ biết rất nhiều điều. Chính Miku đã giúp Ayumu tìm thấy người bạn thất lạc đã lâu, Wakkun. Khi tìm thấy Wakkun, Ayumu nhận thấy Wakkun không hề có vẻ gì là lớn lên kể từ lúc cùng chơi đùa với Ayumu lúc nhỏ. Wakkun lại đang mặc bộ đồ mà Ayumu thường mặc lúc còn nhỏ. Wakkun giới thiệu Ayumu với hai người bạn – là những vật thể kì lạ có thể thay đổi hình dạng – Dosshiru (Doss) và Shisshin (Sense). Chuyện gì đang xảy ra? Tại sao những sinh vật kì lạ này lại xuất hiện ở đây?

Những điều kỳ bí vẫn tiếp tục diễn ra sau đó một năm rưỡi, vào mùa đông, một nữ sinh trung học – Kisa Tanigawa – nhặt được một vật thể kì lạ, tên là Bun-chan trên đường. Kisa mang Bun-chan về nhà và chăm sóc như vật cưng. Và một hôm, cô bé phát hiện ra sự kì lạ của Bun-chan khi nó có thể thay đổi hình dạng.

Sự xuất hiện của phóng viên địa phương – Akira Sukawara – chính là sợi liên kết giữa hai sự việc tưởng chừng như không gắn kết với nhau. Và mọi chuyện diễn biến càng thêm bất ngờ khi Akira tiết lộ: Doss, Sense và Bun-chan là vật thể thiện và vật thể ác; khi chúng gặp nhau, chiến tranh sẽ xảy ra…