Câu chuyện xoay quanh sự tranh giành quyền lực giữa Bộ Pháp Thuật và trường Hogwarts, sự sợ hãi mất uy thế của ông Bộ trưởng Bộ Pháp thuật Cornelius Fudge, và những mánh lới đáng sợ của mụ Dolores Umbridge, giáo viên dạy môn Phòng chống nghệ thuật Hắc Ám do Bộ Pháp Thuật cử đến trường Hogwarts, để chiếm quyền điều hành ngôi trường phù thuỷ từ tay cụ Dumbledore thì bộ phim lại xoáy sâu vào thể loại phim tình cảm học trò.

Đó là câu chuyện về những cô cậu học trò nổi loạn tìm cách chống lại sự độc đoán của bà cô giáo Dolores Umbridge mà đỉnh cao là trò phá bĩnh của hai anh em sinh đôi George và Fred; chuyện tình cảm của Harry Potter cũng được nhấn mạnh, với sự xuất hiện của cô bé Luna Lovegood, những ánh mắt lén lút nhìn theo Harry của cô bé Ginny và đặc biệt là nụ hôn đầu đời của Harry Potter và cô bạn gái Cho Chang; và trên hết là tâm trạng của Harry Potter khi cậu bé cảm thấy mình bị bỏ rơi bởi tất cả bạn bè, người thân, thầy cô và cuối cùng chịu đựng một nỗi đau mất mát rất lớn…